Spécificités phylogéographiques de sous-lignées T de Mycobacterium tuberculosis

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Mycobacterium tuberculosis a évolué en étroite association avec l'homme, menant à des spécificités phylogéographiques de certaines lignées. Une meilleure connaissance de ces lignées en lien avec des aspects cliniques et démographiques aparrait donc comme un prérequis nécessaire au controle de la tuberculose. L'unité Tuberculose & Mycobactérie de l'Institut Pasteur de la Guadeloupe, en collaboration avec des chercheurs de l'Université du Sichuan en Chine, ont exploré la structuration génétique de certaines souches de M. tuberculosis au sein de la lignée Euro-Américaine dont la classification restait jusqu'à présent mal définie. Les analyses bayésiennes sur marqueurs VNTR d'une collection de 607 souches, ont mis en évidence une surprenante spécificité phylogéographique des sous-lignées T de Russie, d'Albanie, de Turquie, d'Iraq, du Brésil et de Chine (régions du Tibet, du Sichuan, de Guizhou, de Chongqing et de Jiangsu). Ces résultats permettront par la suite de suivre l'évolution de ces nouvelles lignées T à l'échelle mondiale.

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Mycobacterium tuberculosis has evolved in close association with his human host, leading to specitic phylogeographical lineages. A better knowledge of lineages and associated clinical and demographical characteristics is a prerequisite to Tuberculosis control. The TB & Mycobacteria unit from the Institut Pasteur in Guadeloupe in collaboration with researchers from Sichuan University in China recently explored genetic structure of previously ill-defined M. tuberculosis T strains within the Euro-american lineage. Bayesian population structure analyses on VNTR markers of a collection of 607 isolates revealed surprising phylogeographical specificities of sublineages defined in Russia, Albania, Turkey, Iraq, Brazil and China (regions of Tibet, Sichuan, Guizhou, Chongqing and Jiangsu). This research will help to further study these newly described T sublineages worlwide.

Source: Bayesian population structure analysis reveals presence of phylogeographically specific sublineages within previously ill-defined T group of Mycobacterium tuberculosis, 6 février 2017

Yann Reynaud*1, Chao Zheng12, Guihui Wu3, Qun Sun2, Nalin Rastogi1

1:WHO Supranational TB Reference Laboratory, Tuberculosis and Mycobacteria Unit, Institut Pasteur de la Guadeloupe, Morne Jolivière 97183 Abymes, Guadeloupe, France

2:College of Life Sciences, Sichuan University, Chengdu, Sichuan 610066, China

3:Chengdu Public Health Clinical Center, Chengdu, Sichuan 610066, China

Lien/URL: http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0171584

Contacts : yreynaud@pasteur-guadeloupe.fr ; nrastogi@pasteur-guadeloupe.fr

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Niveaux et mécanismes de résistance à la Deltaméthrine, au Malathion et au Téméphos, des moustiques Aedes aegypti de Guadeloupe et de Saint-Martin (Antilles françaises)

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Aedes aegypti est l'unique vecteur reconnu des virus dengue, chikungunya et zika en Guadeloupe et à Saint-Martin. Afin d'améliorer les stratégies locales de lutte anti-vectorielle, les niveaux de résistance aux insecticides chimiques des populations de moustiques de cette région ont été analysés ainsi que certaines bases génétiques et mécanismes physiologiques associés. Pour cela, des moustiques ont été collectés en différents points de Guadeloupe et de Saint-Martin et au final, les tests réalisés sur les larves et les adultes femelles issues des différentes localités (six au total) ont révélé de forts niveaux de résistance au Téméphos (8,9<RR50<33,1) et à la Deltaméthrine (8,0<KRR50<28,1), comparé à la souche sensible de référence Bora-Bora. De plus, les investigations moléculaires menées ont mis en évidence la prédominance de génotypes de résistance pour deux mutations Kdr étudiées, V1016I et F1534C, ainsi que la surexpression et/ou l'amplification constitutive de 6 gènes potentiellement impliqués dans les processus de détoxification des insecticides, à savoir la glutathione-S-transférase GSTE2, la carboxy-cholinestérase CCEAE3A et quatre cytochromes P450 à mono-oxygénases : 014614, CYP6BB2, CYP6M11 et CYP9J23. En conclusion, les moustiques de Guadeloupe et Saint-Martin sont multi-résistants aux insecticides (organophosphorés et pyréthrinoïdes) et les résistances sont possiblement associées à des hautes fréquences alléliques des mutations Kdr étudiées, ainsi qu'à l'expression et/ou l'amplification de certains gènes de détoxification. Ce travail devrait permettre de mieux adapter les moyens de lutte anti-vectorielle ciblant Ae. aegypti au niveau local.

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Aedes aegypti is the only recognized vector for dengue, chikungunya and zika viruses in Guadeloupe and Saint-Martin islands. In order to improve local vector control strategies, the insecticide resistance levels and some genetic and physiologic mechanisms potentially associated have been investigated in mosquito populations from this region. Bioassays performed on larvae and adult females revealed that all the six populations examined were respectively highly resistant to Temephos (8.9 <RR50 <33.1) and Deltamethrin (8.0 <KRR50 <28, 1), when compared to the Bora-Bora susceptible strain used as reference. In addition, molecular investigations highlighted the predominance of resistance genotypes for two Kdr mutations studied (V1016I and F1534C), as well as the constitutive over expression and/or amplification of 6 genes potentially involved in insecticides detoxification such as glutathione-S-transferase GSTE2, carboxycholinesterase CCEAE3A and four cytochromes P450: 014614, 014614, CYP6BB2, CYP6M11 and CYP9J23. In conclusion, Aeaegyptimosquitoes from Guadeloupe and Saint-Martin Islands are multi-resistant to insecticides (organophosphorus and pyrethroids), which is possibly linked to the high proportion of Kdr mutations observed in populations, and the over expression and/or amplification of some of the examinated detoxification genes. These results will form the baseline for a deeper understanding of the insecticide resistance levels and associated mechanisms of Ae. aegypti populations and will be used to improve vector control strategies in Guadeloupe and Saint Martin islands.

Lien vers l'article PDF/ URL to the article in PDF: http://link.springer.com/article/10.1186/s40249-017-0254-x

Contacts : daniella.goindin@gmail.com ; avegarua@pasteur-guadeloupe.fr