Spécificités phylogéographiques de sous-lignées T de Mycobacterium tuberculosis

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Mycobacterium tuberculosis a évolué en étroite association avec l'homme, menant à des spécificités phylogéographiques de certaines lignées. Une meilleure connaissance de ces lignées en lien avec des aspects cliniques et démographiques aparrait donc comme un prérequis nécessaire au controle de la tuberculose. L'unité Tuberculose & Mycobactérie de l'Institut Pasteur de la Guadeloupe, en collaboration avec des chercheurs de l'Université du Sichuan en Chine, ont exploré la structuration génétique de certaines souches de M. tuberculosis au sein de la lignée Euro-Américaine dont la classification restait jusqu'à présent mal définie. Les analyses bayésiennes sur marqueurs VNTR d'une collection de 607 souches, ont mis en évidence une surprenante spécificité phylogéographique des sous-lignées T de Russie, d'Albanie, de Turquie, d'Iraq, du Brésil et de Chine (régions du Tibet, du Sichuan, de Guizhou, de Chongqing et de Jiangsu). Ces résultats permettront par la suite de suivre l'évolution de ces nouvelles lignées T à l'échelle mondiale.

Mycobacterium tuberculosis has evolved in close association with his human host, leading to specitic phylogeographical lineages. A better knowledge of lineages and associated clinical and demographical characteristics is a prerequisite to Tuberculosis control. The TB & Mycobacteria unit from the Institut Pasteur in Guadeloupe in collaboration with researchers from Sichuan University in China recently explored genetic structure of previously ill-defined M. tuberculosis T strains within the Euro-american lineage. Bayesian population structure analyses on VNTR markers of a collection of 607 isolates revealed surprising phylogeographical specificities of sublineages defined in Russia, Albania, Turkey, Iraq, Brazil and China (regions of Tibet, Sichuan, Guizhou, Chongqing and Jiangsu). This research will help to further study these newly described T sublineages worlwide.

Source: Bayesian population structure analysis reveals presence of phylogeographically specific sublineages within previously ill-defined T group of Mycobacterium tuberculosis, 6 février 2017

Yann Reynaud*1, Chao Zheng12, Guihui Wu3, Qun Sun2, Nalin Rastogi1

1:WHO Supranational TB Reference Laboratory, Tuberculosis and Mycobacteria Unit, Institut Pasteur de la Guadeloupe, Morne Jolivière 97183 Abymes, Guadeloupe, France

2:College of Life Sciences, Sichuan University, Chengdu, Sichuan 610066, China

3:Chengdu Public Health Clinical Center, Chengdu, Sichuan 610066, China

Lien/URL: http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0171584

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