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et Santé Publique
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Institut Pasteur de Guadeloupe
BP 484
97183 ABYMES Cedex

Tel +590 (0)5 90 89 69 40
Fax +590 (0)5 90 89 69 41
  Responsable d'unité
Dr Nalin Rastogi
 
        
 

L'équipe se compose de 8 personnes :


Equipe  au 1er Janvier 2012:
Chef d'Unité Nalin RASTOGI
nrastogi[at]pasteur-guadeloupe.fr
Chercheur contractuel,
Adjoint Recherche
Thierry ZOZIO
tzozio[at]pasteur-guadeloupe.fr
Chercheur contractuel,
Adjoint Recherche
Julie MILLET
jmillet[at]pasteur-guadeloupe.fr
Microbiologiste, Doctorante Elisabeth STREIT
estreit[at]pasteur-guadeloupe.fr
Bioinformaticien, Doctorant David COUVIN
dcouvin[at]pasteur-guadeloupe.fr
Technicienne Supérieure Mylène BERCHEL
Technicien Supérieure Michel PIOCHE
   
Anciens membres de l'équipe en 2006-2012:
Bioinformaticienne, Doctorante Véronique HILL
vhill[at]pasteur-guadeloupe.fr
Visiting Scientist
(Institut Pasteur St Petersbourg)
Igor MOKROUSOV
igormokrousov[at]yahoo.com
Stagiaire - Biologiste Moléculaire
(2008-2009)
Perrine ROUSSEL
Visiting Scientist (Institut Angeloff - Bulgarie)
(2007-2008)
Violeta VALCHEVA
Bioinformaticien
(2008-2010)
Thomas BURGUIERE
Bioinformaticien
(2006-2008)
Christophe DEMAY
Bioinformaticien
(2005-2006)
Benjamin LIENS
Chargé de Recherche
(1994-2006)
Christophe SOLA
   
Chercheurs reçus pour une thèse ou un DEA (Direction Scientifique : N. Rastogi):
MASTER 2 (Bioinformatique), Univ. Montpellier II (2007) France CASCA
MASTER 2 (Biologie & Sciences de la Santé), Univ. Antilles-Guyane, Guadeloupe (2007) Christophe DEMAY
MASTER 2, Univ. Paris VII, France (2006) William LAURENT
Thèse (Microbiologie), Univ. Antilles-Guyane, Guadeloupe (2005) Karine BRUDEY
Thèse (Microbiologie), Univ. Paris VII, France (2004) Séverine FERDINAND
DEA (Biologie Moléculaire & Biodiversité), Univ. Antilles-Guyane, Guadeloupe (2002) Karine BRUDEY
Thèse (Microbiologie Médicale & Moléculaire), Faculté de Médecine, Grenoble, France (2002) Ingrid FILLIOL
Thèse (Microbiologie), Univ. Paris-VI, France (2001) Eric LEGRAND
DEA (Microbiologie Moléculaire), Univ. Toulouse, France (2001) Séverine FERDINAND
DEA (Maladies Infectieuses), Univ. Aix-Marseille, France (1999) Eric BELTAN
Thèse (Microbiologie), Univ. Paris, France (1998) Lionel HORGEN
Thèse (Microbiologie), Univ. Aix-Marseille, France (1997) Anne DEVALLOIS
Thèse de médecine, Faculté de Medicine, Tours, France (1995) Henri ROUSSEL
   
Stagiaires :
Le laboratoire reçoit 5 à 6 stagiaires/an pour les stages de courte durée (moins d'un an). Pour tout renseignement veuillez contacter le chef d'unité :
Tel : 0590-89 38 81, 0590-89 76 61
Fax : 0590-89 69 41
e-mail : nrastogi[at]pasteur-guadeloupe.fr
(remplacer [at] par @ lors de contact par mail).
   
Anciens stagiaires:

2007

2006
Stage de fin de contrat (début stage 07/01/05) dans le cadre du Volontariat Civile à l'Aide Technique (VCAT)
Objet : « Traitement des données de typage moléculaire des souches de M. tuberculosis par les outils bio-informatique » 
LIENS Bejamin 01/01/06 – 28/02/06
(2 mois)
Stage de fin de contrat (début stage 01/02/05) dans le cadre du Volontariat Civile à l'Aide Technique (VCAT)
Objet : « Mise en place – GBEA Recherche » 
MILLET Julie 01/01/06 – 15/05/06
(4,5 mois)
Stage dans le cadre du Volontariat Civil à l'Aide Technique (VCAT)
Objet : « Développement des outils bio-informatiques et la mise en place du site internet de l'IP Guadeloupe » 
DEMAY Christophe 01/03/06 – 28/02/07
(12 mois)
Stage dans le cadre des échanges scientifiques (visiting scientist), et la mise en place d'un projet de collaboration sur la tuberculose avec la Turquie
Objet : « Apprentissage de méthodes moléculaires pour l'étude de l'épidémiologie moléculaire de la tuberculose dans la région de Zonguldak, Turquie » 
AKTAS Elif 17/03/06 – 15/04/06
(4 semaines)
Convention de stage de deuxiè année de Licence. Spécialité Sciences de la Vie. Université de Cergy-Pontoise
Objet : « Apprentissage de méthodes moléculaires pour le typage de M. tuberculosis » 
MAMERT Vanessa 03/07/06 – 01/09/06
(9 semaines)

2005
Stage dans le cadre du Volontariat Civil à l'Aide Technique (VCAT)
Objet : « Traitement des données de typage moléculaire des souches de M. tuberculosis par les outils bio-informatique » 
LIENS Bejamin 07/01/05 – 31/12/05
(12 mois)
Stage Doctoral dans le cadre d'une Convention de Recherche IRD (Institut de Recherche pour le Développement) et Institut Pasteur de Guadeloupe ; IRD, Cayenne, Guyane Française
Objet : « Épidémiologie de la tuberculose sur l'île de Cayenne : Spatialisation des cas et des Facteurs de risques » 
GURNIER Vanina 10/01/05 – 25/02/05
(7 semaines)
Convention de stage de 2ème année de BTS ; spécialité : Biochimie, Lycée Grégor Mendel, Vincennes
Objet : « Apprentissage de méthodes moléculaires (spoligotypage et VNTRs) pour le typage de M. tuberculosis » 
COCLÈS Corinne 24/01/05 – 18/02/05
(4 semaines)
Stage dans le cadre des échanges scientifiques (visiting scientist), et la mise en place d'un projet de collaboration sur la tuberculose avec la République Dominicaine
Objet : « Apprentissage de méthodes en Mycobactériologie clinique » 
GARCIA Vicente 14/02/05 – 04/03/05
(3 semaines)
Stage dans le cadre de la coopé- ration technique et scientifiques avec l'Angola, financé par le Ministère des Affaires Etrangères, France
Objet : « Apprentissage de méthodes en Mycobactériologie clinique et la mise en place d'un projet de collaboration sur la tuberculose avec l'Angola » 
RAMOS Maria Eugénia 14/02/05 – 06/05/05
(12 semaines)
Stage dans le cadre du VolontariatCivile à l'Aide Technique (VCAT)
Objet : « Mise en place de GBEA - Recherche » 
MILLET Julie 01/02/05 – 31/01/06
(12 mois)
Convention de stage de Maîtrise de Biologie des Populations et des Ecosystèmes, Univ. Antilles-Guyane Pointe-à-Pitre, Guadeloupe
Objet : « Epidémiologie moléculaire de la Tuberculose dans la région Antilles-Guyane » 
MAGDELEINE Murielle 07/03/05 – 17/06/05
(15 semaines)
Stage dans le cadre de la convention de l'Internat avec l'Assistance Publique – Hôpitaux de Paris
Objet : « Stage de Master 2 – Recherche de l'Université Paris V : préparation d'un Mémoire – Épidémiologie mol;éculaire de la tuberculose dans la région Antilles – Guyane  » 
LAURENT William 02/11/05 – 01/11/06
(12 mois)

2004
Stage dans le cadre d'une boursedu Réseau International de l'Inst. Pasteur et Instituts Associés, Institut Pasteur de Madagascar, Tananarive, Madagascar
Objet : « Analyse des profils génétiques des souches de M. tuberculosis de Madagascar et Océan Indien » 
RASOLONAVALONA Tiana 10/01/04 - 14/02/04
(1 mois)
Stage dans le cadre des échanges scientifiques (visiting scientist), Institut Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, Brésil
Objet : « Analyse des résultats de génotypage (spoligotypes) de M. tuberculosis obtenus au Brésil » 
GOMES, Harrison M. 14/01/04-28/01/04
(2 semaines)
Stage Doctorale dans le cadre d'une Convention de Recherche IRD (Institut de Recherche pour le Développement) et Institut Pasteur de Guadeloupe ; IRD, Cayenne, Guyane Française
Objet : « Épidémiologie de la tuberculose sur l'île de Cayenne : Spatialisation des cas et des Facteurs de risques » 
Mlle GURNIER Vanina 29/03/04 – 18/06/04
(12 semaines)
Convention de stage de 1ère annéede l'École Nationale Véterinaire de Toulouse
Objet : « Apprentissage de méthodes moléculaires pour le typage de M. tuberculosis » 
Mlle GROOT KOERKAMP, Sophie 05/04/04 – 30/04/04
(4 semaines)
Convention de stage de 1ère annéede l'École Nationale Véterinaire de Toulouse
Objet : « Méthode d'identification rapide de mycobactéries non- pigmentées à croissance rapide par une technique de PCR-RFLP sur le gène hsp65 » 
Mlle LEJEUNE Amandine 05/04/04 – 30/04/04
(4 semaines)
Convention de stage de TER de Maîtrise de l'Informatique, Univ. Antilles-Guyane, Pointe- à-Pitre, Guadeloupe
Objet : « Développement d'une application (en langage C ou Java) permettant de modéliser le processus évolutif des spoligotypes de M. tuberculosis » 
M. ABDOUL Philippe 19/04/04 – 04/06/04
(7 semaines)
Convention de stage pré-DoctoralPointe-à-Pitre, Guadeloupe
Objet : « Apprentissage de Méthodes moléculaires en Mycobactériologie » 
M. ZOZIO Thierry 26/04/04 – 25/06/04
(8 semaines)
Convention de stage de Maîtrise de Biologie des Populations et des Ecosystèmes, Univ. Antilles-Guyane Pointe-à-Pitre, Guadeloupe
Objet : « Epidémiologie moléculaire de la Tuberculose dans la région Antilles-Guyane » 
Mlle LARMURE Agnès 03/05/04 – 18/06/04
(7 semaines)
Convention de stage de Maîtrise de Biologie des Populations et des Ecosystèmes, Univ. Antilles-Guyane
Objet : « Génotypage de M. tuberculosis par analyse des MIRUs (Mycobacterial Interspersed Repetitive Units) » 
Mlle GRIVALLIERS Laura 03/05/04 – 18/06/04
(7 semaines)
Convention de stage de BTSspécialité : Biochimie, Lycée Grégor Mendel, Vincennes
Objet : « Identification des mycobactéries par une méthode de PCR-RFLP » 
Mlle COCLÈS Corinne 17/05/04 – 02/07/04
(7 semaines)
Convention de stage de Licencede Biochimie, UFR des Sciences, Université de Montpellier II, Montpellier
Objet : « Génotypage de souches de M. tuberculosis de la région Antilles-Guyane par analyse des VNTRs (Variable Number of Tandem DNA Repeats) » 
Mlle DURPÈS Marie-Claude 15/07/04 – 28/08/04
(7 semaines)
Visiting Scientist, Chef de Labo-ratoire - Tuberculose, International Center for Diarrhoeal Disease Research, Dhaka, Bangladesh.
Objet : « Technique de Phylo- génétique, d'épidémiologie molé- culaire et de bio-informatique appli- quées à la surveillance et au contrôle de la Tuberculose » 
Dr. RAHIM Zeaur 13/10/04 – 26/10/04
(2 semaines)

2003
Stage dans le cadre d'une bourse d'échange – International Atomic Energy Agency (IAEA), Vienne, Autriche ; Poursuite d'une collaboration avec le Dept. of Medical Biochemistry, School of Health Sciences, University of Stellenbosch, South Africa
Objet : « Typage souches MDR de M. tuberculosis par Spoligo- typing et comparaison avec la base de données IP Guadeloupe » 
Mlle STREICHER Elizabeth 13/01/03 - 12/02/03
(1 mois)
Stage dans le cadre du ProjetTDR de l'OMS portant sur les essais thérapeutiques des anti- tuberculeux combinés en Haïti, Les Centres GHESKIO, Haïti.
Objet : Apprentissage identifica- tion et antibiogrammes de BK
Mme MABOU Marcelle 15/05-23/05/2003
(2 semaines)
Stage dans le cadre du ProjetTDR de l'OMS portant sur les essais thérapeutiques des anti- tuberculeux combinés en Haïti, Les Centres GHESKIO, Haïti.
Objet : Apprentissage identifica- tion et antibiogrammes de BK
Mme EXILUS Micheline 15/05-23/05/2003
(2 semaines)
Stage dans le cadre du ProjetTDR de l'OMS portant sur les essais thérapeutiques des anti- tuberculeux combinés en Haïti, International Child Care (ICC), Haïti.
Objet : Apprentissage identifica- tion et antibiogrammes de BK
Mme HALL Marlène 15/05-23/05/2003
(2 semaines)

2002
Stage dans le cadre d'une boursePost Universitaire, Convention de collaboration avec le Dept. d'infor- matique, Univ. Antilles- Guyane
Objet : « Approche bioinformatique par fouille de données d'empreintes génomiques de BK » 
M. VALETUDIE Georges 15/10/01-14/10/02
(12 mois)
Stage dans le cadre des étudesPost Universitaires, Tulane Univ. School of Public Health and Tropical Medicine, New Orleans
Objet : « Epidémiologie moléculaire de la tuberculose  » 
Mlle AGA Roxanne 07/01-06/09/2002
(8 mois)
Stage dans le cadre du Projet Académie, RIIPA-Institut Pasteur du Maroc, Casablanca
Objet : « Typage des souches MDR de M. tuberculosis par spoligotyping » 
Mlle EL BAGHDADI Jamila 18/02-01/03/2002
(2 semaines)
Stage dans le cadre du Projet Académie, RIIPA-Institut Pasteur de Côte d'Ivoire, Abidjan
Objet : « Typage des souches MDR de M. tuberculosis par spoligotyping » 
Mlle GUESSENND Nathalie 18/02-01/03/2002
(2 semaines)
Stage dans le cadre du Projet Académie, RIIPA - Laboratoire de Référence – Mycobactéries, Institut Pasteur, Paris
Objet : « Typage des souches MDR de M. tuberculosis par IS6110-RFLP et spoligotyping » 
Mlle GUTIERREZ Cristina 15/04-24/04/2002
(10 jours)
Stage dans le cadre du Projet TDR de l'OMS portant sur les essais thérapeutiques des anti- tuberculeux combinés en Haïti, Les Centres GHESKIO, Haïti.
Objet : Réalisation des Antibio- grammes de BK
Mme Micheline LUPSAINT 15/04-26/04/2002
(2 semaines)
Stage dans le cadre du Projet TDR de l'OMS portant sur les essais thérapeutiques des anti- tuberculeux combinés en Haïti, Les Centres GHESKIO, Haïti.
Objet : Réalisation des Antibio- grammes de BK
Mme JOCELYN Gabrielle 15/04-26/04/2002
(2 semaines)
Stage dans le cadre des études de Maîtrise de Biologie Cellulaire, Université de Rennes-I
Objet : « Typage moléculaire des souches de M. tuberculosis par MIRUs et VNTRs » 
Mlle LAURENT Dina 15/04-15/06/2002
(2 mois)
Convention de stage de TER de Maîtrise d'Informatique, Faculté de Sciences, Université des Antilles et de la Guyane
Objet : « Conception et réalisation de la base de données ACCESS pour les spoligotypes de M. tuberculosis : : programmation de son interface d'utilisation » 
Mlle DELFINO Christel 06/05-22/06/2002
(4 mois)
Stage dans le cadre des échanges avec le CHU de Pointe-à-Pitre :
Objet : « Apprentissage de la Mycobactériologie Clinique » 
Mlle PORTALIER Sylvie 13/05-17/05/2002
(1 semaine)
Convention de stage de TER de Licence de Biologie Cellulaire & Physiologie, Université Paris-XII
Objet : « Typage moléculaire de souches de M. tuberculosis » 
Mlle MARTIAL Dominique 01/07-30/08/2002
(2 mois)
Stage dans le cadre des échanges scientifiques avec le Foundation for Medical Research – FMR, Bombay, Inde
Objet : « Apprentissage des Outils Moléculaires pour le typage des souches multirésistantes de M. tuberculosis isolées en Bombay » 
Mlle D'SOUZA Desirée 11/09-22/10/2002
(6 semaines)

2001
Stage dans le cadre des études deMédecine (4ème année), Faculté de Médecine de l'Université de Göteborg, Suède
Objet : « Typage moléculaire des souches de M. tuberculosis isolées en Suède »
M. MOSTRÖM Peter 02/05-09/07/2001
(10 semaines)
Stage dans le cadre des études deMédecine (4ème année), Faculté de Médecine de l'Université de Göteborg, Suède
Objet : « Typage moléculaire des souches de M. tuberculosis isolées en Suède »
M. GORDON Max 02/05-09/07/2001
(10 semaines)
Stage dans le cadre de Maîtrise,Faculté des Sciences Exactes, UAG
Objet : « Apprentissage de méthodes moléculaires pour l'épidémiologie de la tuberculose »
Mlle AUBERY Alexandra 10/05-21/06/2001
(6 semaine)
Stage dans le cadre de Maîtrise,Faculté des Sciences Exactes, UAG
Objet : Utilisation de la bio- Informatique pour l'étude de la biodiversité des mycobactéries
M. LEREMON Valentin Philippe 04/07-03/08/2001
(4 semaines)
Convention de stage d'Ingénieur (3ème année) de l'Ecole de Biologie Industrielle, Cergy-Pontoise
Objet : « Utilisation de la bio- informatique et de la biologie moléculaire pour l'étude de la biodiversité des mycobactéries »
Mlle DUCHÊNE Véronique 19/07-17/09/2001
(9 semaines)
Convention de stage de License de Biotechnologie (3ème année), Univ. de Sherbrook, Canada
Objet : « Apprentissage de méthodes moléculaires pour le diagnostic et l'épidémiologie des mycobactéries »
Mlle BAPTISTE Catherine 03/09-28/12/2001
(4 mois)

2000
Laboratoire des Mycobactéries, Ministère de la Santé, MSPP-Haïti
Objet : Apprentissage de la mycobactériologie clinique appliquée à la Lèpre.
Mme Denise DERIVOIS 03/12-08/12/2000
(1 semaine)
Laboratoire des Mycobactéries, Ministère de la Santé, MSPP-Haïti
Objet : Apprentissage de la mycobactériologie clinique appliquée à la Tuberculose
Mlle Micheline LUPSAINT 27/11-08/12/2000
(2 semaines)
Laboratoire des Mycobactéries, Ministère de la Santé, MSPP-Haïti
Objet : Apprentissage de la mycobactériologie clinique appliquée à la Tuberculose
Mme marie-Carmen MARCELLUS 27/11-08/12/2000
(2 semaines)
Convention de stage de première année de Magistère de Pharmacologie, Université de Nice Sophia-Antipolis.
Objet : Apprentissage des techniques de laboratoire en mycobactériologie.
Mlle Anne-Aurore PAYART 08/08-25/08/2000
(3 semaines)
Convention de stage de License de Biologie, Université Paris-Sud.
Objet : Apprentissage de méthodes moléculaires pour le typage des mycobactéries.
Mlle Lynda LOUIS 03/07/11/08/2000
(6 semaines)
D.E.U.G., Université d'Angers.
Objet : Apprentissage de mycobactériologie clinique appliquée à la Tuberculose (Financement ANRS)
Mme Maryse TIMOTHÉE 15/05-31/05/2000
(2 semaines)
Laboratoire des Mycobactéries, Les Centres GHESKIO-Haïti.
Objet : Apprentissage de mycobactériologie clinique appliquée à la Tuberculose (Financement ANRS)
Mme Patricia DE MATTEIS 15/05-26/05/2000
(2 semaines)
Convention de stage «Formation par la Recherche» Institut Pasteur, Paris
Objet : Typage moléculaire des souches de BK isloées en Haïti (financement ANRS)
Mlle Béatrice VERDOL 03/04-31/10/2000
(7 mois)
Boursier postdoctoral .Institut Pasteur de Saint-Petersbourg, Russie.
Objet : Étude de la biodiversité et caractéristation moléculaire des souches de BK de Russie.
Dr Igor MOKROUSOV 24/01-15/07/2000
(6 mois)

1999
Stage post-universitaire aprèsMaîtrise de Microbiologie, Université Louis Pasteur, Strasbourg
Objet : Apprentissage de méthodes moléculaire en mycobacteriologie
Melle FERDINAND Séverine 03/05-30/07/99
(3 mois)
Convention de stage de Maîtrise de Biologie Cellulaire (option génétique), Université de la Méditerranée Aix-Marseille II.
Objet : L'étude de la Biodiversité des Mycobactéries
Mlle NEGRONI Laetitia 21/06-31/08/99
(10 semaines)

1998
Cadre légal jumelage Ecole-Entreprise, Ste. Marie-La Croix 92160-Antony
Objet : Eléctrophorèse d'ADN
Vikram BHATNAGAR 23/03-28/03/98
(1 semaine)
2ème cycle en Biologie Cellulaire,Université d'Angers.
Objet : Typage moléculaire de Mycobacterium tuberculosis
Jérôme MAÏSETTI 29/06-30/10/98
(4 mois)

1997
D.E.U.G., Université d'Angers.
Objet : Typage moléculaire de Mycobacterium tuberculosis par spoligotyping
Jérôme MAÏSETTI Juin – août
(1 mois et demi)

1996

1995

1994
Ph.D., Chef de l'Unité de Mycobactériologie, Southern Research Institute, Birmingham, Alabama, U.S.A. (1994) William W. Barrow